他发表简短声明后，飞奔去搭“空军一号”。但“空军一号”起飞后，在特勤局的命令下改道，在佛州、路易斯安纳州和内布拉斯加州的空军基地和碉堡间绕来绕去几小时。布什在飞机上与白宫重要幕僚联系。

布什回忆说：“我对他们说，我们要回华盛顿，但他们认为，我如果回到刚刚被攻击的城市，是不负责任，当时我们不知道还会发生什么事。”

他说：“我们不知道是否还有其它飞机被劫持，因此我在空军一号上做的第一个决定，就是命令空军击落任何对降落要求没有响应的客机。要空军击落一架满载美国公民的客机，是极困难的决定，但我认为这是保护国家的最佳手段。”