中华航空目前的主要大股东，当局主导的中华航空事业发展基金会持股超过39%，“国发基金”也超过11%，两者合计超过50%。叶匡时表示，华航是上市公司，而且是一家赚钱的公司，台湾无论要发展东北亚航空或两岸航线，都需要有一个强有力的航空机队。他形容，华航可说是泛公股主导的民营上市公司，如果“国发基金”不增资，泛公股的持股将低于50%，华航的经营主导权可能被其他财团拿走，他相信全民都不乐见这个结果发生。中华航空公司也回应表示，“国发基金”是2009年时增资华航50亿元，当时是由“行政院”专案核准，而且有会计师核价，增资案是经过公开程序办理。

马办则回应，马办指出，请民进党不要紧张，宇昌案已经要解密，把事情说清楚就好，民进党没必要在此时转移焦点。