2011年，卫生部新公布21项食品安全标准，包括食品中真菌毒素限量、农药残留限量、复配食品添加剂、预包装食品标签和营养标签等基础标准，针对6种真菌毒素的28个限量标准、54种农药的118个限量标准等安全使用作出了严格规定。根据监管工作需要，公布《速冻面米制品》、《不锈钢制品》等重点产品标准，制定、指定216项食品添加剂产品标准。修订公布食品添加剂使用标准，明确规定了23类、2314种食品添加剂的使用范围、用量，依法撤销了39种食品添加剂。对行业提交的3000余种食品包装材料进行系统清理，公布了107项包装材料用树脂名单，公告禁止双酚A用于婴幼儿奶瓶生产。

在食品安全整顿工作期间，卫生部会同相关部门出台加强违法使用非食用物质加工食品案件查办和移送工作文件，加大对违法使用非食用物质加工食品行为的打击力度；组织各地持续开展问题乳粉清查和违法添加非食用物质的排查工作，及时督办社会影响恶劣，群众高度关注的染色馒头等重点案件；开展了“瘦肉精”、“地沟油”等专项整治行动，查处了一批违法案件，严惩了一批犯罪分子。目前，全国绝大部分省份建立了食品安全事故调查处理队伍，完善了事故调查处理机制和相关工作制度。