灾后畜禽防疫是关键
水灾过后，要做到“大灾之后无大疫”的关键一条就是对死亡畜禽做好无害化处理。只要高度重视、科学防疫、排出积水、清理圈舍、改善环境、彻底消毒，就能有效地预防和控制疫病的流行。
做好猪群免疫
重点消毒猪群、猪舍及运动场、屠宰场（点）、销售场地、仓库、猪群运输车辆、用具等，饮水消毒剂可用漂白粉、氯制剂等，猪场环境消毒可以用烧碱、石灰和氯制剂等；水灾害极易造成多种动物传染病、寄生虫病流行，要做好猪群免疫工作，对新补栏或超过免疫保护期的猪群，要立即开展口蹄疫、高致病性猪蓝耳病、猪瘟等疫苗的补免；加强饲养管理，做好猪舍通风换气、保持舍内空气新鲜，加强饮水管理，保持舍内相对干燥，适时降温，在饲料中适当添加保健药物，以提高猪群抵抗力。
严格鸡场消毒
养鸡场应在场地消毒、防病防霉、降温降湿等环节下足工夫。
鸡舍消毒。可用5％来苏儿溶液、2％氢氧化钠溶液、5％的漂白粉混悬液或10％～20％的石灰乳等对鸡舍、鸡笼及食用槽具等进行喷洒消毒，对运动场地等鸡舍周围环境可在清洗后撒生石灰消毒。
洪水过后的水源多会受到影响，一定要对水源进行严格的把关。在饲料或饮水中添加维生素和微量元素，增强鸡体的体质；添加抗菌药物，防止肠道疾病的发生。要勤换垫料，垫料要消毒干燥，可间断性地在鸡饲料内添加60毫克/升的氯苯胍或0.05％的克球粉，亦可用50毫克/升的盐霉素以防止球虫病的发生。建议不要轻易应用注射的方法给药。
连续下雨之后，饲料易受潮甚至被淹，再加上天气炎热，极易滋生霉菌，所以一定要观察饲料是否发霉，一旦发现要立即更换，没有发霉的可晒干，添加制霉菌素后饲喂。发病鸡除服药外，还可饮用1:3000的硫酸铜溶液。
为提高鸡的抗热应激能力，鸡只日粮能量降低10％～15％，饲养密度降低20％，其饮水中按每公斤添加1克维生素C和0.3克水杨酸钠。
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