在公益性事业单位中，承担义务教育、基础性科研、公共文化、公共卫生及基层的基本医疗服务等基本公益服务，不能或不宜由市场配置资源的，划入公益一类。承担高等教育、非营利性医疗等公益服务，可部分由市场配置资源的，划入公益二类。根据国务院2009年出台的事业单位改革时间表，此次即将发布的“岗位绩效工资制度”进行的改革，只针对除义务教育学校和基层卫生机构和乡镇卫生院两类事业单位的其他类事业单位，也就是事业单位改革的第三步。

尽管如此，《事业单位岗位绩效工资制度》涉及的人员和事业单位依然不在少数，并且情况更为复杂。目前，中央各部委所属事业单位、其在地方的派出和衍生事业单位、以及地方所属事业单位等均在下一步改革之列，这些事业单位获得财政补贴的来源各不相同。以高等院校为例，高校既有地方院校，又有教育部直属院校，同时还有一些部属院校、省部共建院校等。有关人士说，上述情况中，推动事业单位改革和绩效工资改革的原则是，事业单位直属于谁、谁管理，就由谁来负责，多部门共管的，多部门协商推进。具体到事业单位人员的绩效工资，也是根据这一原则，单位属于谁，绩效工资就由谁的财政来负担。