陈其迈说，“行政院”在通过决定前，会将公文敬致“院长”、“副院长”，进行核示，因此第一份公文会有两人签名，从公文最后标明“拟同意由翁院长代表进行协商事宜，敬请核示”，便能得知这是需经过“院长”同意才能行使授权的公文。

他指出，第一份文件主旨标明“请鉴核”，代表这是请求核示准或不准的公文，但第二份公文主旨为“请鉴查”，代表这只是告知谈判过程的进度报告，没有核示问题，所以无需上呈至“院长”，这是一般的公文流程。